הקרן למפעלי שיקום מפעילה יחידות אבחון בכל מרכזי השיקום. בערים ת"א, רחובות נתניה וחיפה, מפעילה הקרן מכוני אבחון, (מכוני "קרן"), שהינם נפרדים פיזית ממרכז השיקום, אך שייכים ארגונית לשירותים אותם המרכז נותן. ביחידות האבחון עובדים רכזי אבחון, שהינם ברובם פסיכולוגים שיקומיים תעסוקתיים ומאבחנים בעלי השכלה אקדמית במדעי החברה וריפוי בעיסוק. יחידות האבחון מבצעות סוגים שונים של אבחונים:  ü       אבחון תעסוקתי  ü       מיון תעסוקתי  ü       אבחון פסיכודיאגנוסטי  ü       אבחון נוירופסיכולוגי  ü       אבחון פסיכודידקטי  ü       אבחון דידקטי  ü       אבחון תצפיתי

אבחון הבודק את כישוריו ויכולותיו של האדם, למול מגבלותיו ובהתאמה עם מרכיבי אישיותו. כלי האבחון הינם מגוונים וכוללים מדגמי עבודה, מבחני נייר ועיפרון, מבחנים פסיכולוגים, מבחני ריפוי בעיסוק, מבחנים ממוחשבים של "תיל-אינטרנשיונל" ותצפית על המאובחן. האבחון עונה על השאלה "לאיזה מקצוע האדם מתאים?"
תהליך האבחון כולל אינטייק (ראיון עומק) ע"י פסיכולוג, העברת בטריית (סט) אבחונים ע"י מאבחנת ומסירת תוצאות אינטגרטיביות ע"י הפסיכולוג, שביצע את האינטייק.

המלצות האבחון הינם ישימות ומותאמות לשוק העבודה ולאפשרויות הכלכליות שיקומיות, הריאליות העומדות לרשות האדם.

המיון התעסוקתי

הינו מצומצם יותר ונועד לענות על השאלה: "האם האדם מתאים למקצוע ספציפי ? ".

אבחון פסיכודיאגנוסטי

אבחון לצורך קביעת כוחות ומגבלות אישיותיות של המאובחן, נערך ע"י פסיכולוג שיקומי, תעסוקתי או קליני. כלי האבחון כוללים בטריית אבחונים אישיותיים מוכרים, מהימנים ותקפים.

אבחון נוירופסיכולוגי

אבחון המיועד לאנשים הסובלים מפגיעות ראש ובעיות נוירולוגיות, נערך ע"י פסיכולוגים שיקומיים תעסוקתיים וכולל בטריית אבחונים נוירו פסיכולוגים מוכרים, האבחון הנוירופסיכולוגי נועד לדייק ביכולותיהם הקוגניטיביים והרגשיים של אנשים עם פגיעות נוירולוגיות.

אבחון דידקטי ופסיכודידקטי

האבחון הדידקטי, נערך ע"י מאבחנות דידקטיות, אשר בודקות את יכולות הלמידה במקצועות ספציפיים כגון: חשבון, עברית, אנגלית. האבחון ממפה קשיים ולקויות למידה ונותן המלצות על דרכים חלופיות ללמידה.

האבחון הפסיכודידקטי נערך ע"י פסיכולוגים חינוכיים מומחים ונותן תמונה מקיפה של לקויות למידה, בשילוב קשיים רגשיים, כולל המלצות לטיפול ושיפור יכולות הלמידה.

אבחון תצפית

האבחון התצפיתי, מיועד לאנשים אשר אבחון קצר אינו מתאים להם. מדובר באוכלוסיות אשר לחצי האבחון הקצר משפיעים לרעה על תוצאות האבחון שלהם, או אשר מלכתחילה אינם ערוכים לעמוד בלחצים של אבחון קצר. בנוסף לאוכלוסיות אלו, מדובר על אוכלוסיות שהמבחנים הסטנדרטים אינם מאפיינים אותם, ולכן לא ניתן להגיע להמלצות מתאימות עבורם, אלא באמצעות תצפית.

האבחון התצפיתי, משלב תחנות עבודה בתחומים שונים, בהם המאובחן מתנסה בעבודה, לצד תצפית מובנית הנערכת ע"י מאבחן – מרפא בעיסוק מומחה בתחומו.

האבחון התצפיתי, מאפשר לאוכלוסיות האמורות לקבל תוצאות אבחון עם המלצות מתאימות, למרות הקושי לעמוד באבחון תעסוקתי רגיל.

בבדיקות מעקב אחר יחידות האבחון השונות, נמצא כי אחוז הניבוי של האבחון מגיע לכ-80%.